Habár a szemdörzsölés ártalmatlannak tűnhet, komoly kockázatot vállal az, aki ezt a megoldást választja a szemviszketés enyhítésére. A szemdörzsöléssel kapcsolatos legsúlyosabb kockázat a szaruhártya elvékonyodása és a szaruhártyakopás. A szem dörzsölése kötőhártya alatti vérzést is okozhat. Végül pedig, ha nem elég tiszta a kezünk, könnyen kialakulhat kötőhártya-gyulladás is, amit másoknak is átadhatunk. Éppen ezért tanácsos elkerülni a szemdörzsölést, ha pedig gyakori ingert érzünk, alaposabban is utánajárni, mi lehet az oka.